Создание макрологистических систем основано на следующих общих методологических принципах:
- Системный подход, требующий рассмотрения всех элементов логистической системы как взаимосвязанных и взаимодействующих для достижения общей цели функционирования системы, при этом осуществляется оптимизация функционирования не отдельных элементов, а логистической системы в целом.
- Принцип тотальных затрат, требующий учета всей совокупности издержек, связанных с управлением материальными и сопутствующими им информационными, сервисными и финансовыми потоками по всей логистической цепи, начиная от момента зарождения потока вплоть до поступления его конечному потребителю.